脓疱型牛皮癣的组织学特征为表皮内出现限局性含中性粒细胞的脓疱。早期改变见于真皮，出现血管扩张及血管周围淋巴细胞浸润，24小时内表皮水肿，乳头内毛细血管周围的中性粒细胞开始向上方表皮移入，在变性及变薄的棘层上部角质形成细胞间隙内中性粒细胞聚集，形成海绵状脓疱，随着皮损成熟，脓疱中央的表皮细胞发生溶解，同时脓疱增多，终随表皮向上移动，成为角层下脓疱。脓疱开始为Kogoj海绵状脓疱，以后成为更大的Munro脓肿。
掌跖脓疱病早期损害为真皮乳头上方的表皮下部有海绵形成及单核细胞浸润，以后发展成其中含单核细胞的表皮内水疱。当水疱扩展时，大量中性粒细胞进入腔内成为脓疱。当白细胞穿过水疱壁的细胞时，可见海绵状脓疱的组织学特点。充分发展的脓疱为表皮内房性脓疱，两侧钝圆，轻度隆起于皮面，脓腔内含许多中性粒细胞。脓疱周围表现为轻度棘层肥厚，脓疱下方则有炎性浸润。在脓疱两侧常可见小而典型的海绵状脓疱。这些海绵状脓疱与泛发性脓疱型牛皮癣相似。