选择运动疗法治疗脂肪肝时，应该以有氧运动为主，因为有氧运动的强度相当于大摄氧量的40%～60%，运动心率相当于高心率的70%～80%，对增强心血管功能、呼吸功能、改善血糖、血脂代谢都有明显的作用，同时持续有效的运动还能去除腹部的内脏脂肪。有氧运动包括快步走、游泳、慢跑、爬坡、做健身操、蹬功率车、跳绳、打兵乓球等。而仰卧起坐、瑜伽等属于无氧运动，不适合脂肪肝的治疗。
运动量要每天坚持30分钟以上，每周坚持3～5次，如果是中青年脂肪肝患者，每周运动量要尽量在6小时以上，以大吸氧量60%的运动强度时，减肥降脂的效果是明显的，如果运动量达不到大吸氧强度的40%时起不到减肥的效果。运动时的心率应维持在170-年龄，心率高不超过200-年龄。
对于运动量的判断可从心率上监测，如果在运动时心率的次数低于170-年龄5次以上，说明运动量不达标;反之如果心率的次数高于200-年龄5次以上，说明运动量过大了。心率随着运动，持续加快且在标准范围内30分钟以上，运动所致的疲劳感于运动后20分钟内消失，说明运动是有效的。
控制体重时减肥的速度不能过快，以每周体重下降小于0.5kg为标准，减肥过快反弹也会快，而且过快降低体重反而会加重肝细胞内脂肪变，严重者还会诱发脂肪性肝炎。
此外，脂肪肝患者的运动治疗还有很多主意事项，运动前需与医生制定详细的运动计划，以免在运动过程中出现其他危险。