胸腺在重症肌无力的发病过程中起着重要作用，胸腺内合成的乙酰胆碱受体抗体直接封闭或破坏人体神经-肌肉的突触上的乙酰胆碱受体，阻止运动神经信号传递，可引起重症肌无力的始动抗原也存在于胸腺。而将胸腺切除是阻断这种病理过程的有效手段。据统计，约有75%～85%的患者经手术切除胸腺加综合治疗后可获得显著改善或比较好地缓解。
单纯眼肌型重症肌无力患者如果对激素反应良好，一般可不进行手术。Ⅰ期和部分症状较轻的Ⅱ期重症肌无力患者可以先试用非手术疗法，如效果不理想可选择胸腺切除，Ⅱ～Ⅳ型重症肌无力患者可以胸腺切除作为优选治疗方案。如果重症肌无力由浸润型胸腺瘤引起，应及早进行手术。
如果5岁以前即发生重症肌无力，一般不采用手术治疗，以免影响胸腺在生长和发育过程中的生理作用，65岁以上的老年人考虑到对手术的耐受性比较差，也应谨慎选择胸腺切除治疗。
特别提醒：胸腺切除的疗效多在术后几个月以后才能显现，患者不可过于忧虑。