偏头痛和三叉神经痛有时会相混淆，故应对两者症状进行仔细区分。
偏头痛
可分为无先兆和有先兆两种类型，但以无先兆常见。发病前无明显的先兆症状，头痛呈缓慢加重状态。患者一侧或两侧枕额部出现反复发作的搏动性疼痛，常伴有恶心、呕吐、畏光、乏力等全身不适症状；有先兆偏头痛不多见，头痛出现前会有前驱症状，如视物模糊、闪光、暗点等，存在时间一般不会超过1小时。疼痛位于一侧或两侧枕颞部，或眼眶周围，呈持续性搏动痛，发作时间可达4~6个小时或更长时间，并伴有恶心、呕吐、畏光、疲劳等症状。
三叉神经痛
三叉神经分布区域内，突然出现呈刀割样、针刺样、烧灼样或撕裂样的剧烈疼痛，有时可达到痛不欲生的程度；疼痛由口腔或下颌的某一点开始，并扩散到三叉神经的某一支或多支，但局限在面部中线以内；发作时患者突然停止进食、说话等活动，可出现皱眉咬牙、张口掩目的特殊表情，或使劲用手揉搓面部。发作持续时间由数秒到1~2分钟不等，说话、洗脸、刷牙、吃饭等动作可诱发发作，且上唇、鼻翼、口角、舌、眉等处有扳机点。