大多数急性前列腺炎患者需要住院治疗，住院后要立即留取尿和血标本进行常规检查和培养，之后应用大剂量抗生素。
抗生素的选择
症状轻微且对复方新诺明无过敏的患者，初始治疗一般优选复方新诺明，每天口服两次。症状较重者应采用胃肠道外静脉的给药途径，在未明确致病菌种类之前，可给予青霉素、链霉素、氨基甙类抗生素等，直到药敏实验的结果回报。明确致病菌种类后，再根据药敏结果给予相应的抗生素治疗。一般来讲肠杆菌科或假单胞菌属引起的感染可使用氨基甙类抗生素，而肠球菌用氨苄青霉素。
作用机制
虽然上述抗生素都是非脂溶性的，而且在理论上它们不能弥散进入前列腺，但临床研究却表明前列腺组织和前列腺液中的药物浓度常能达到消灭细菌的水平，这是由于急性炎症打破了正常的生理屏障，使大部分抗生素能够进入前列腺的结果。
并发症的处理
有急性尿潴留的患者，特别是同时伴有前列腺增生的患者，宜采用膀胱穿刺造瘘引流尿液，而不宜行经尿道留置导尿管，因为这样会引起患者严重的不适，并加重前列腺的感染。CT检查、经直肠前列腺超声检查等对前列腺脓肿的诊断较有意义，如果经证实确属前列腺囊肿，一般常需经会阴或经尿道切开引流处理。
