在根据病原学检验结果选择了适当的种类与剂量后，合理的使用是有效治疗前列腺炎的关键。

　　足够的剂量与疗程

　　选择确定了抗菌药物之后，治疗过程中必须给予足够的剂量与疗程，绝不可因为该药可能存在的毒性或副作用、生活工作情况等而随意减少用量或缩短疗程。药物的不规范使用不但不能有效治疗前列腺炎，而且还可由此导致病原体耐药性的形成、细菌细胞壁缺陷变异及感染的扩散。

　　联合用药

　　抗菌药物的联合使用不但有利于减少或避免细菌耐药性的形成，而且也有利于减少或避免药物对人体毒性或副作用的形成。尤其对于具有多种或大量病原体感染、易形成耐药性菌株感染、易发生细胞壁缺陷变异菌株感染或多重耐药性菌株感染的患者，通常要考虑联合使用两种或以上抗菌药物。

　　停药后复查

　　一个疗程完成之后，无论症状是否缓解都必须停药且进行病原学检查。如果引起炎症的病原体对所使用的抗菌药都是敏感的菌株，在此一个疗程的治疗中将会全部被杀灭，因此没有必要再继续使用抗菌药，但如果经治疗后仍有病原体存在，那么这些残留的病原体通常是对所用抗菌药具有耐药性的菌株，此时应更换治疗方案。