半月神经节注射治疗三叉神经痛的并发症常有以下几种：
(1)三叉神经第一支损伤：由于三叉神经第一支的神经纤维传导重要的是角膜感觉，一旦损伤叫引起角膜感觉消失，以至造成神经麻痹性角膜溃疡。为此，一旦术后发现角膜反射消失，或已发现有角膜炎征象时，应立即滴眼药水、途服药膏、带眼罩或防风眼镜、湿敷封盖患眼等给予角膜保护。
(2)三叉神经运动根损伤：运动根损伤可引起同侧咬肌、颞肌、翼内肌、翼外肌的瘫痪，影响咀嚼运动。.应尽量避免选用半月节和下颌神经酒精阻滞法。如出现以上症状可用营养神经药物、理疗、功能锻炼等综合治疗。
(3)其他神经组织损伤：半月神经节阻滞后酒精可在根腔内扩散，尤其在注射速度过快、剂量过大时，酒精可扩散到半月神经节周围的蛛网膜下隙，而引起头痛、头晕、恶心、呕吐、眼球震颤、呼吸困难、心律失常、甚至引起抽搐、昏迷、休克等症状，亦可遗留蛛网膜粘连。应严格控制穿刺的深度和注入酒精的速度和剂量，一般不应超过0.5～1毫升，注射时应缓慢。在注射过程中应严密观察病人的血压、脉搏、呼吸等情况的变化，一旦发生头痛、头晕、恶心、呕吐等症状，应立即停止注射，进行相应的对症处理。