治疗三叉神经痛的各种手术同其他外科手术一样，出现并发症也是难免的，但这绝不应成为因责任心不强而酿成并发症的理由。对于并发症必须尽量减少或避免发生。
关于三叉神经痛的治疗，除需处理引起疼痛的原因，如切除小脑桥脑角区的肿瘤、分离解除压迫感觉神经的责任血管进行减压等手术外，其手术的主要目的是解除病人的疼痛，而解除病人疼痛的同时，还应尽量保持原神经的生理功能不受破坏，尤其对于所谓的原发性三叉神经痛(血管性压迫)。然而各种手术均因各种不同原因和因素，可能发生或存在不同程度的并发症。有报道指出手术治疗三叉神经263例，在经颞和颅后窝行感觉根切断术的247例中，12例发生严重并发症，其中7例导致死亡。当然，这些年来随着科学技术的发展，神经外科显微外科技术的发展，并发症及死亡率明显减少。