除了精神治疗及药物治疗为，ED患者也可以选择手术治疗。但ED的手术治疗适用于静脉性和动脉性勃起功能障碍。
阴茎静脉手术：包括阴茎背深静脉结扎术、阴茎脚静脉结扎术、坐骨海绵体肌折叠术、尿道海绵体剥脱术、髂内静脉结扎术等。但静脉手术并非理想治疗方法，可能与勃起功能障碍病因较复杂，病人往往非单纯静脉问题，常常与其他因素如心理、动脉、神经以及阴茎组织结构病变等有关。
此外，阴茎假体置入也是治疗勃起功能障碍的一种有效的手术方法，适用于经其他方法治疗无效的器质性及某些心理性勃起功能障碍病人。目前假体主要有半硬性棒状阴茎假体、可膨胀式三部件假体、可膨胀式双部件假体、可膨胀式单部件假体。据统计，在接受阴茎假体置入治疗的患者中，手术并发症与机械故障约占7%～25%，感染者约1%～8%，穿孔者1.6%～6.7%，疼痛约0.4%～5.7%，假体大小不适约0.7%～2%。
ED患者应该通过医生的诊断检查，进一步选择适合自己的治疗方法。